Ćwiczenie 3- Przetrwalniki
Impreza plenerowa w KieĹpinie 22 kwietnia 2007
Gr.11) opisać zależności między: SpoOA, spoOA, spoOH, abrB, AbrB
2) opisać odporność spor na wysokie ciśnienie
3) porównać podział symetryczny i asymetryczny
4) rozwinąć skróty: cwlJ, SASP, SL, gerA
5) Prpe wpływa pozytywnie na transkrypcję ger K i ger B, nie wpływa na transkrypcję gerA. Jak alanina i AGFK wpłynie na kiełkowanie spor przy zastosowaniu Δprpe
Gr.2
1."A co to..?": recA, FtsZ i SPL.
2. Przedstaw schemat kielkowania przetrwalnikow, wraz z zaznaczeniem miejsca dzialania: niskoczasteczkowych zw. odzywczych, DPA, cisnienia do ok 100MPa (chyba), lizozymu.
3.Podaj 6 czynnikow egzogennych wywolujacych sporulacje i 4 czynniki endogenne.
4.Narysuj wykres kielkowania dla szczepu 168, z delecja (w gerABK i prpE (Oo? -zgubilam sie w oznaczeniach, juz nie wiem co to bylo...))oraz z delecja w tym na p only, jesli indukujemy AGFK.
5.Cykl zycia bialek SASP z zaznaczeniem miejsca powstania, degradacji, funkcji w kielkowaniu oraz w stanie uspionym...
6. ostatnie pytanie dotyczylo regulacji przez AbrB Spo0F i Spo0A czy jest to regulacja pozytywna czy negatywna
Gr.3
1. wyjasnij skroty: recA, CotE, uvrB, FtsZ..i cos jeszcze
2. jakie uszkodzenia w przetrwalnikach wywoluje promieniowanie UVA i UVB
3. produkt genu x wplywa pozytywnie na ekspresje genu ssp ktory odpowiada za proces kielkowania. narysowac wykres zdolnosci kolonii do kielkowania ktory zawiera zdolnosc szczepu dzikiego, szczepu z delecja x i szczepu z delecja i x i ssp
4. Mechanizm zabijania przez wys cisnienie
5. schema budowy przetrwalnika
Gr.4
1. Wyjaśnij: spo0F, cotE, outgrowth
2. Mechanizm odporności na wysuszenie.
3. Jakie są wzajemne zależności w ekspresji genów pomiędzy kom. macierzystą a presporą? (czy jakoś tak)
4. Mamy spory bez płaszcza. Czy uda się zaindukować ich kiełkowanie w przypadku:
- stymulacji niskocząsteczkowymi zw. odżywczymi
- ciśnieniem do 100 MPa
- egzogennym DPA.
No i wyjaśnić dlaczego tak a nie inaczej.
5. Wykres odporności na promieniowanie UV dla szczepów: 168, (del)sigG, (del)sspA.
6. Które z elementów budowy spory są pochodzenia "matczynego", a które są nowosyntetyzowane? Pokaż na schemacie.
jak myślicie, na czym trzeba się skupić przy uczeniu się?na tych wszystkich artykułach po ang, czy może poszukać jeszcze dodatkowych info?
mysle ze skoro w literaturze podal tylko te 3 publikacje to powinno wystarczyc ale nie wiem;/
na ostatnik zajęciach kobieta mówiła, ze powinniśmy skupiać się na tych publikacjach
o jeny...
ale tych tekstow jest tak duzo ze wow, bedzie wesolo i juz sie ciesze i dalej nie ogarniam...
no ale skoro tyle tego to mysle ze one w miare wyczerpuja temat i chyba nie trzeba bedzie szukac wiecej...
Zadziwiacie mnie na każdym kroku.
jak to jest ze w spisie zagadnien jest tekst "Bacillus subtilis and other Gram-positive bacteria" i tak nazwany plik jest w extranecie, ale jak sie mu przyjzec to i autor inny i tytul i wogole, tak ze mam drobne watpliwosci.. myslicie, ze to dobry tekst?
- Spore germination
- Resistance of Bacillus Endospores to Extreme Terrestrial and Extraterrestrial Environments
- i taki zzipowany folder o sporulacji
jeżeli ktoś ma ochotę na 3 dodatkowe artykuły (które były w materiałach od 3. roku) oraz sprawozdanie to bardzo proszę
http://rapidshare.com/files/231387602/3_dodatkowe_publikacje.zip
dodatkowe arytukułY?! xD
plis niech ktos to uploadnie na jakims innym serwerze niz rapidshare.... po raz kolejny apeluje do ignorantow z zewnetrzym IP, ktorego nie musza dzielic na wespol z cala siecia.....
http://wyslijto.pl/plik/k076tc5cd5
Bylam u Obuchowskiego, i powiedział że teksty na extranecie to są te które mamy się nauczyć i są wystarczające. To dla tych którzy poczuli się zaszczuci materiałami od Tomka;)
a pytałaś może czy w tym dużym i złym tekście brać pod uwagę całe bakteryjne życie pozaziemskie??
bo dziś gadałam z empem i mówił żeby tą dalszą częścią się nie przejmować...
ja sie nikogo nie pytałam i sama stwierdziłam, że wystrzeliwanie spor na Marsa to nie do konca temat naszych badań
Nie Asiu, o tym nie pomyslalam zeby zapytać;D
<ściana>
my sie z justyna o to pytalysmy obucha i on powiedzial ze kosmosu na cw badac nie bedziemy
taaaaaak.... bo jeszcze ich nie stac na rakiety
Na prawdę, przerazacie mnie czasami
Pytania grupy pierwszej:
1. Porównaj odporność spor na promieniowanie UV i gamma. Czym się różnią, a co jest wspólne?
2. Budowa spory od zewnątrz do środka.
3. Co poza związkami odżywczymi może zaindukować kiełkowanie (3 czynniki)?
4. Które podjednostki polimerazy są potrzebne przy tworzeniu płaszcza?
5. Dlaczego wewnątrz spory nie ma metabolizmu?
Co do pytań podanych przez Martynkę:
w 4. Podać jeszcze kolejność ich działania
A uprzedzam pytania, skończyliśmy ok 17
Nie wszystko pamietam:
1. jakie warunki (ze względu na wilgość) zapewniają lepsza odpornośc na ciepło. Na jakie elementy spory działa suche ciepło a na jakie wilgotne ciepło?
2. jakie czynniki sigma (ile ich jest) bieora udział w sporulacji i w jakiej kolejności występują?
3. Czemu hydrolizie ulega tylko kora a nie ściana komórkowa?
4. opisać SASP - co robia w sporze
5. dlaczego kiełkowanie jest nieodwracalne?
Pytania były trochę inaczej sformuowane, ale sens chyba ten sam
Z tego co podajecie, to wynika, że pytania, które podawała Justyna się nie pojawiają. Te są sensowne i nie aż tak szczegółowe jak te wszystkie literki, które pojawiają się w pierwszym poście...
Te pytania co wrzuciłam na forum są od trzeciego roku, a oni mieli trochę inną literaturę( ktoś inny prowadził też te ćwiczenia), dlatego się nie powtarzają.
Oni mieli inne teksty wiec i inne pytania
fajna stronka
http://www.scribd.com/doc/7788107/Mikrobiologia-Ogolna-Hans-G-Schlegel
od strony 102 zaczynają się spory
mam tą książkę w wersji archaicznej papierowej wypożyczoną. i albo faktycznie po prostu nie lubię mikrobiologii albo nieciekawa ta książka jest zwyczajnie ;p
>nie lubię mikrobiologii
nie lubisz
fajna, dzięki GosiaMam pytanie do publicznosci. Czy wiecie moze z jakiejs literaury lub od prowadzacego ktory induktor AGFK czy L-Ala jest lepszym induktorem dla zwyklego najnormalniejszego szczepu dzikiego 168 bez zadnej delecji PrpE? Jesli nie wiecie to chociaz napiszcie jak wam wyszlo z wynikow pomiarow absorbancji. Zalezy mi tylko na wynikach w szczepie dzikim 168.
Pytania grupa 4.
1. Porównanie kiełkowania pod niskim i wysokim ciśnieniem <dokładnie tak jak przepowiedziałam;D >
2. Funkcje Spo0F i Spo0B
3. dlaczego lizozym nie załatwia spor?
4. ile operonów kodujących receptory kiełkowania znaleziono w genomie B.Subtilis. Co aktywuje receptory?
5. dlaczego spora traci odporność na ciepło w czasie kiełkowania
Ad. do 1. brzmiało ono bardziej: dlaczego pod wysokim ciśn przetrwalniki są odporne na promieniowanie UV a pod niższym niż 100MPa już nie są odporne:P
i to z operonami było podstępne bo 3 są normalnie ładnie pięknie, ale jeszcze 2 są takie co albo funkcji nie mają albo nie wiadomo, jaka jest
mozna jeszcze dodac, ze najlepsza grupa z grupy 4 skończyła o 16
Mam pytanie do publicznosci. Czy wiecie moze z jakiejs literaury lub od prowadzacego ktory induktor AGFK czy L-Ala jest lepszym induktorem dla zwyklego najnormalniejszego szczepu dzikiego 168 bez zadnej delecji PrpE? Jesli nie wiecie to chociaz napiszcie jak wam wyszlo z wynikow pomiarow absorbancji. Zalezy mi tylko na wynikach w szczepie dzikim 168.
PLX HELP!!!!!!!!
Może nikt nie robił na dzikim
a wy grupa srodowa nie robiliscie 2 szczepow? - bo my poniedzialkowi robilismy na bank indukcje pokarmowa na obu szczepach, w obu podgrupach! zajrzyj do swoich notatek i wynikow plis!!!!!
hej,
sory, że dopiero teraz - mam jakieś sprawka z zeszłego roku i tam stoi, że L-ala ma większego kopa. wysłałem mejlem,
(aaa, tylko tamto to nie jest szczep dziki, ylko mutant, ale z taką mutacją, która nie powinna przeszkadzać)
pozdro
mi chodzi o tegoroczne wyniki niestety - moglby ktos napisac jakie mu absorbancie powychodzily?
albo moze gdzies ktos wyczytal w literaturze co jest lepszym induktorem?
ja mam porównywalne absorbancje dla obu, ale pod koniec czasu trochę wieksze dla AGFK
Olu - robiłam z Asia dla szczepu 168 i dla deltaE. jak chcesz za pare godzin moge Ci podeslac mailem moje wyniki, bo niedlugo sie zabiore za wklepywanie ich do kompa.
tak przy okazji, apropo tego szczepu deltaE, to jest szczep z delecja genu prpE, co robil ten gen?? w sensie czy ta delecja wplynie jakos na to kielkowanie, bo nie pamietam co to za gen?
Prpe wpływa pozytywnie na transkrypcję ger K i ger B, nie wpływa na transkrypcję gerA
pyt:
1.ktora warstwa utrzymuje dehydratacje rdzenia, jakie ma ona (dehydratacja) znaczenie
2. ktory czynnik odpowiada za lize komorki przy sporulacji, gdzie sie on znajduje (komorka czy spor)
3. czynniki za odpornosc na ktore odpowiada plaszcz
4. w jaki sposob sa aktywowane enzymy lizujace kore przetrwalnika
5. skad przetrwalnik czerpie aminokwasy do syntezy bialek po rozpoczeciu kielkowania (poza zrodlami zewnetrznymi)
dla wszystkich co się z sprawkiem bawią i mają problemy ze szczepem delta E
http://www.biotech.ug.gda.pl/dodatki/ogloszenia_255.pdf
tak deltaE słabiej kiełkuje