Ćwiczenia 4 - Odpowiedź na stres
Impreza plenerowa w KieĹpinie 22 kwietnia 2007
Gr.11. Dlaczego w doświadczeniu wykorzystujemy hodowlę B. subtilis o OD 0,2-0,3?
2. Wymień i opisz krótko białka wiążące mRNA rpoS u E.coli.
3. Aktywacja białek poprzez fosforylację/defosforylację w regulacji sigmyB
4. Opisz grupę paralogów RsbR (nie trzeba było ich wymieniać wszystkich).
Gr.2
1. Dlaczego używamy bakterii z genem fuzyjnym ctc-LacZ?
Odp. ctc to promotor odpowiadajacy tylko na sigmaB, a produktyem LacZ jest beta-galaktozydaza, ktorej stezenie mozemy oznaczyc.
2. Co to sa stresosomy? Opisac je.
3. Dlaczego czesc bialek bioracych udzial w odpowiedzi na stres u B. subtillis jest kodowana niezaleznie od czynnika sigmaB?
4.Czym sie roznia, a w czym sa podobne geny E. coli RpoS i RpoH"
Gr.3
1.co to jest antisense-antisense
2.jakie promotory odpowiadaja za transkrypcje genow
3. czy sproulacja moze być ogolna odpowiedzia na stres
4. odpowiednik RsbT bacillusa u E.coli (RssB)
Gr.4
1.jedno pytanie było o droge srodowiskowa i jaki czynnik jest na koncu aktywowany lub jaki ja wywoluje
2. I jedno bylo testowe i byly odpowiedzi: na poziomie transkrypcji, b)translacji c)cos zupelnie innego ale nie pamietam. Jak człowiek nic na to nie umiał to jak miał zapamiętać, litości!
3.Było jeszcze trzeba podac definicję czegoś na litere t
Kolokwium ze "stresu" dla grupy 2 (ćwiczenia przypadają na 27 maja) odbędzie się w dniu 25 maja w budynku przy ulicy Kładki, o godzinie 9:30 w sali im. prof. Taylora.
Martynka, my jestesmy grupa 1
Wiem, lae umieszczam informację, żeby nie było, że nie widzieli.
No i pięknie, pomylił się bo chodzi o grupę 3
niedługo będziecie mnie chyba chcieli zabić, bo odzywam sie tu tylko wtedy kiedy mam jakis interes 0_0' ale zaryzykuję raz jeszcze i rzuce prosbę, czy ktos miły, kto nie ma labów w grupie nr3 byłby w stanie łaskaw zamienić się ze mna na grupy?? moge pójsc w kazdym terminie tylko nie w srodę, bo dostałam opcje dorobienia przy asekuracji dzieci na sztucznej sciance i bardzo potrzebuje mieć w tym dniu wolne
Prosięęęęęę
Marta u nas jest jedno miejsce wolne w grupie <wtorek> wiec mysle ze mozesz przyjsc. tylko ze to bedzie TEN wtorek;
to i tak wejsciowka dzien pozniej niz w naszej grupie
No tak, w zasadzie tak:P wiec mysle ze nie powinno byc problemu
ok, a wiecie kto prowadzi te ćwiczenia? jak tak to czy moge prosic maila do tej osoby?
Mniemam że to ten:
Pan Adam Iwanicki;]
maly@biotech.ug.gda.pl
maly??
xDtak, to tłumaczy czemu Obuchowski mówił na niego "Mały" :DDDDDDD
Dzisiejsze pytania grupy 3 (nie wiem czy dokładnie takie, bo szybko mi dyktowali:P):
1. Ogólny sens odpowiedzi na stres
2. Jaka jest wspólna droga aktywacji sigma B w różnych drogach?
3. Co aktywuje translację sigma S dla E. Coli?
4. Jak będzie wyglądała delecja RsbX? (aktywność sigma B po czynniku stresowym i bez niego)
5. Główny regulator E. Coli w niskiej temperaturze (20 stopni)
w 1 to chodziło chyba o to 'po co w ogóle to jest'
dzieki bardzo za adres małego
Są już wyniki naszej wejściówki w ekstranecie.
Pytania 1 grupy:
1. Jakie są gółówne cechy ogólnej odpowiedzi na stres?
2. Co to jest stresosom i do czego on służy?
3. Jaką aktywność sigB uzyskamy w del::rsbWrsbV i del::rsbUrsbP? Wyjaśnić?
4. Które z poziowów aktywacji sig u E.coli są regulowane podczas szoku cieplnego?
5. Jakie podjednostki sig biorą udział w odpowiedzi na stres cieplny?
co do pytania trzeciego to były trzy różne szczepy
1- delta::rsbW
2- delta::rsbV
3- delta::rsbU delta::rsbP
o ktorej skonczyliscie?
o 16
hmm.. rozumiem że bakterie niebędące B.subtilisem tudzież E.coli mnie nie interesują?
jakies sprawozdanie z poprzednich lat...bardzo marne..no ale zawsze cos http://rapidshare.com/files/238856982/sprawozdanie.zip
Asiu, najdłuższy tekst jest o E.coli i połowa pytań z wejściówek dotyczy E.coli.
hmm.. rozumiem że bakterie niebędące B.subtilisem tudzież E.coli mnie nie interesują?
E.coli bardzo nas interesuje i daja o to dużo pytań. Inaczej nie daliby całego tekstu o E.coli xD
no tak tak. jako że mój polski jest nieziemsko poprawny, szczególnie jeśli chodzi o składnię i używanie przecinków, to mi potem takie wychodzą nieogarnięte zdania
właśnie chodziło mi o to, że interesują nas tylko B.subtilis i E.coli i żadne inne =)
a swoją drogą tekst o E.coli mi się niebardzo podoba ;p
zgadza sie, nie interesują nas inne bakterie
pytania nasze ale ja jestem padnięta więc nie recze czy tak były sformuowane i czy czegoś nie przekręce.
1. co to jest krzyzowa odporność w kontekscie ogólnej odp na stres u B.s.
2. jak temp wpływa na transkrypcje u E.coli
3. podobieństwa w regulacji sigma b i sigma f
4. na jakich poziomach regulowana jest ekspresja u E.coli
5. czym się różnią T/S i W/V/sigmab
2. raczej na translację
bez różnicy - nie doczytałem pytania i napisałem o obu etapach xD
1.jakie sa 2 czynniki aktywujace odpowiedz na sters u B.subtilis (chodzilo o aktywacje przez czynniki srodowiskowe i energetyczne)
2. opisac wspolny fragment aktywacji odpowiedzi na stres w obu powyzszych szlakach (ten z RsbW i RsbV)
3. co robi RsbX i dlaczego nie ma odpowiednika przy sporulacji
4. rola struktury drugorzedowej mRNA rpoS
5. glowna roznica szlakow aktywacji odpowiedzi na stres u E.coli i B.subtilis